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單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit PGS
TAKARA/ Clontech Rubicon Genomics(RB3050/R30050)
Rubicon Genomics成立于2000年,總部位于美國密歇根州,致力于研究和開發基因組(Genomics Amplification)技術,其產品廣泛應用于NGS測序文庫的構建和單細胞水平的研究。 Rubicon Genomics (RB3050/R30050) PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒用于PCR和基因芯片文庫制備,以檢測拷貝數變異和染色體的非整倍性。長期以來,PicoPLEX WGA Kits 一直得到體外受精(IVF)同盟成員中的ling先供應商比如 BlueGnome(Illumina 公司)的信任并用于胚胎植入前遺傳學篩查和診斷(PGS/PGD)。
單細胞DNA擴增生成高重現性文庫已不再是夢想。PicoPLEX™ WGA試劑盒經zhuan利技術設計和優化,于單個細胞的單拷貝基因組DNA擴增,整個過程在單管中進行,減少了操作誤差,顯著縮短了時間,降低了背景值。分離所獲達6 pg to 50 pg g量的DNA也可以使用PicoPLEX™ WGA試劑盒構建文庫。所獲產物用于芯片比較基因組雜交(CGH)分析和PCR反應。受美國zhuan利保護。從單細胞(或<15 pg DNA)獲得高重現性的結果等位基因呈現(allele representation)具重現性應用簡單,自動化水平高,芯片和PCR結果清晰 。
Rubicon Genomic正式更名為TAKARA/ Clontech
TAKARA/ Clontech 超過30年的服務生命科學研究領域,并支持各種實驗應用的試劑盒和試劑,專注細胞和分子生物學研究。Clontech Laboratories, Inc.(現Takara Bio USA, Inc.)。
TAKARA/ Clontech Rubicon Genomics單細胞全基因組擴增試劑盒訂貨信息
TAKARA/ Clontech R30050 PicoPLEX™ WGA Kit, 50 reactions
TAKARA/ Clontech R300644 PicoPLEX™ WGA Kit, 500 reactions
TAKARA/ Clontech R300671 SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 24Rxns
TAKARA/ Clontech R300672 SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 960Rxns
TAKARA/ Clontech R300673 SMARTer PicoPLEX Single Cell WGA Kit 480Rxns
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單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit特性:
1. 單細胞擴增高重性
使用 PicoPLEX WGA Kit 擴增流式分選的細胞。每個細胞以相同的速率擴增,并得到一個類似的,可預測的產量。樣品含 0 個細胞(無模板對照)顯示出非常低的背景。
2. CNV數據高重現性
PicoPLEX WGA Kit 擴增單卵裂球活檢標本,Genesis 遺傳研究院完成標記和雜交 BlueGnome 的 24sure 芯片。
3. 等位基因表達研究高重現性
位點特異的q-PCR定量分析獨立的單細胞文庫(independent single-celllibraries)中的48位點。從左到右三個圖顯示的是用10 pg DNA分別使用PicoPLEX WGA試劑盒,GenomePLEX?和GenomiPhi所獲結果。90%的PicoPLEX產物可經測序序列證實,可重復性高。
【產品應用】
PicoPLEX® WGA Kit 單細胞全基因組擴增試劑盒的適用范圍十分廣泛,多種原始材料和微量樣品均可通過該試劑盒進行單細胞全基因組擴增,隨著國家二胎政策的開放,在胚胎植入前遺傳學篩查和診斷(PGS/PGD)應用尤其廣泛;
•生物標志物研究(CNVs、SNVs) •體外受精胚胎植入前基因測序 •轉基因動物基因分型 •胚胎和干細胞研究 •單精子分型 腫瘤 •體細胞遺傳變異分析 •腫瘤進化和發展
•腫瘤干細胞 •循環腫瘤細胞 細菌 •宏基因組學研究 •微生物基因分型
單細胞全基因組擴增試劑盒 PicoPLEX® WGA Kit問與答:
1. PicoPLEX WGA試劑盒的推薦DNA輸入是什么?
1-10人細胞(如囊胚、極體、滋養細胞、羊膜細胞、CTCs、培養細胞
2. PicoPLEX®WGA試劑盒推薦哪些應用程序?
拷貝數變異(CNV)分析:寡核苷酸和BAC aCGH較好
SNP基因分型
PCR檢測突變
3.在使用PicoPLEX WGA試劑盒之前,是否有一種不粘接的洗滌緩沖液可以用于單細胞洗滌?
這還沒有在Rubicon基因組公司得到證實,但一些客戶已經成功地使用了聚乙烯醇;例如0.1%)在PBS中清洗/收集細胞。此外,洗滌/收集緩沖液(PBS)也必須是無Ca和mg的。
4. 流程排序有特殊要求嗎?
是的,我們強烈建議不要固定,使用光散射或相位對比來分類或收集樣品。成功分選細胞的顯微/視覺確認可用于優化分選條件。
5. PicoPLEX WGA試劑盒的樣品輸入體積是多少?
這個工具包將容納5μl示例輸入音量/反應多(2.5μl移行細胞和緩沖區)。
6. PicoPLEX WGA Kit的產品可以直接帶到NGS嗎?
不。
7. Rubicon Genomics是否有適合單細胞應用的ngs試劑盒?
是的,PicoPLEX DNA-seq可以用于Illumina NGS平臺。
8. Sigma-Aldrich銷售的是GenomePlex WGA工具包,它與PicoPLEX WGA的技術相同嗎?
不,PicoPLEX使用不同的技術。
9. 對于PicoPLEX WGA產品,預期的基因組位點表示和雜合度損失(LOH)是什么?
為便于參考,請參閱下表中從第三方獲得的數據。
SNP基因分型方法單細胞擴增
snp呼叫成功率
pcr 95% > 95% < 10%
Illumina Infinium SNP陣列占95% 50% - 60% 7% - 12%
10. 這種技術的產物是單鏈的還是雙鏈的?
PicoPLEX WGA的終產物是單鏈和雙鏈DNA的混合物。
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